员工保险扣税的方式如下：
免税之外的保险金：企业为员工支付的免税之外的保险金，应在企业向保险公司缴付时（即该保险落到被保险人的保险账户）并入员工当期的工资收入，按“工资、薪金所得”项目计征个人所得税，税款由企业负责代扣代缴。
五险一金：工资先扣除五险一金（社会保险和住房公积金），然后再扣除个人所得税专项扣除项目。
专项扣除项目：专项扣除项目包括子女教育、继续教育、赡养父母、房贷/房租、大病医疗等五大项。
可以在企业所得税前扣除：企业为职工缴纳的基本社会保险费和住房公积金，在计算企业应纳税额时，这部分支出可以扣除。
不得扣除税额：企业为投资者或员工支付的商业保险费（除特殊工种职工的人身安全保险费和国务院财政、税务主管部门规定可以扣除的其他商业保险费外），不得扣除税额。
总结：
企业为员工支付的保险金中，免税之外的保险金需要并入员工当期的工资收入，并按“工资、薪金所得”项目计征个人所得税，税款由企业代扣代缴。个人所得税的扣除顺序是先扣除五险一金，再扣除专项扣除项目。企业为员工缴纳的基本社会保险费和住房公积金可以在企业所得税前扣除，而其他商业保险费则不得扣除。
