处理新房房顶不平的问题，可以遵循以下步骤：
确认腻子层是否存在脱层、空鼓或平整度偏差大的地方。
将有空鼓、脱层或开裂的部分铲除。
在基层涂刷界面剂，以便于腻子更好地粘结。
使用腻子进行找平，注意每次找平的厚度不宜超过5mm，避免后期出现脱层问题。
对于较大面积的平整度问题，可以考虑分批次进行找平。
找平后，使用砂纸打磨至平整，然后进行下一步的涂刷工作，如刷漆等。
如果房顶不平差值较大（如大于3cm），可能需要采用石膏板吊顶或其他特殊方法进行找平。
对于坡度小于2cm的不平，可以使用石膏和腻子进行找平。
对于坡度大于3cm的情况，建议使用石膏板吊顶或造型顶进行掩饰。
根据购房合同内容，要求开发商对房顶不平进行修复及可能的损失赔偿。
请根据具体情况选择合适的处理方法，并确保施工质量和安全。
