薪酬发放过程中存在以下风险：
企业未按照劳动合同约定的工资数额和支付周期进行支付，如无故拖延发放或擅自降低工资。
企业支付的工资低于当地最低工资标准，可能是由于对最低工资标准的理解有误或计算错误导致。
在相同或相似岗位上工作的员工，由于性别、户籍、身份等因素，获得不同的薪酬待遇。
工资表中代扣的个税金额未按税法规定计算，存在人为计算错误或故意少交个税的情况。
工资表上的员工是否属于公司真实的人员，是否存在虚列名册、假发工资现象。
企业所发放的工资薪金是否符合股东大会、董事会、薪酬委员会或相关管理机构制订的工资薪金制度规定。
工资薪金的调整是否有序进行，是否依法履行了代扣代缴个人所得税义务。
企业是否将所有员工的个税在金税三期个税申报系统中依法申报。
员工是否存在两处以上所得未依法申报的情况。
企业以实物及有价证券替代货币支付工资，或未向劳动者提供本人的劳动报酬清单。
在病假、停工停产、未休年休假等特殊情况下，企业未按照法律规定支付工资。
年终奖的发放与否、条件及标准如果在劳动合同或规章制度中规定不明确，或企业随意更改政策，可能会引发劳动争议。
企业通过虚构残疾人员用工人数、虚假发放工资等手段骗取增值税退税款。
