民间借贷纠纷结案的方式主要有以下几种：
借贷双方就借款的偿还和利息支付等协商一致，达成和解协议，履行完毕后，借贷纠纷自然结案。
可以通过第三方调解机构如人民调解委员会进行调解，调解成功后签订调解协议，具有合同效力。若当事人自愿进行司法确认，经法院确认有效的调解协议具有强制执行力。
在法院诉讼过程中也可进行调解，法院出具的调解书具有强制执行力，如果一方不按照调解书履行义务，另一方可以直接向法院申请强制执行。
如果双方无法协商或调解不成，债权人向法院提起诉讼。法院审理后作出判决，原被告按照判决内容履行义务。如果在诉讼过程中，原告撤诉，只要法院裁定准许撤诉，案件也会结案。
通过仲裁机构进行仲裁，仲裁裁决具有法律效力，如果一方不履行，另一方可以向法院申请强制执行。
当双方当事人按照民间借贷合同的约定，全面履行了各自的义务，包括借款人按时足额偿还借款本金及利息等，此时借贷关系已经终结。债权人可以向法院申请撤回起诉，法院经审查后，如认为符合法律规定，会裁定准予撤回起诉，案件就此结案。
若民间借贷曾经过诉讼程序，在履行完毕后，债权人应及时向法院申请撤诉或要求法院出具结案文书。法院会对履行情况进行审查，确认无误后出具相应的法律文书，标志着案件的终结。
法院或相关机构会将案件的相关材料进行归档，包括判决书、调解书、还款凭证等，以备日后查询和核查。
建议
选择合适的结案方式：根据具体情况和需求选择最合适的结案方式，如双方和解、调解或诉讼等。
及时履行义务：一旦达成和解或判决，应尽快履行相关义务，避免进一步的法律纠纷。
保留证据：在整个过程中，务必保留好所有相关证据和文件，以备不时之需。
希望以上信息能对您有所帮助。
